מרכז "מעברים" מפעיל מודל עבודה ייחודי – בבסיסו עובד קהילתי תעסוקתי, אשר בשיתוף הקיבוץ, עוסק בפיתוח הון אנושי לפרנסה ותעסוקה. העובד הקהילתי תעסוקתי פועל בשניים עד שלושה קיבוצים במשולב ובכך מאפשר התייחסות אזורית לנושא התעסוקה. העובדה בקיבוץ מתבצעת ברמה הפרטנית והמערכתית ומשתפת גורמים מקצועיים שונים מתוך הקיבוץ לכדי עשייה משותפת.
מרכז "מעברים" מקיים קשר שוטף עם ובין אנשי הקשר השונים, רפרנטים במושבים ועובדים קהילתיים תעסוקתיים במרחב, המאפשר בניית רשת אזורית הכוללת את כלל מרכיבי הקהילה באזור וביניהם מעסיקים ומוסדות שונים.